fatal: Authentication failed for 'https://github.com/user/repo.git/'

送った資格情報が拒否されたという意味です。間違っている、期限が切れている、あるいはそのリポジトリに必要な権限のないトークンです。よくある落とし穴は、期限切れのトークンが資格情報ヘルパーに残っている場合で、尋ねられることもなくそれが送られ、毎回同じ行が出ます。fix にある git credential reject の一行は保存されたその項目だけを消して次回また尋ねさせるので、新しいトークンを貼り付けられます。消すのは保存された資格情報だけで、リポジトリのデータには一切触れません。

printf 'protocol=https\nhost=github.com\n\n' | git credential reject — 実行する前に、この命令が何を捨てるかを上の説明で確かめてください。

git です。Gitの仲間で、文句は5語です。